El Consejo de Rectoras y Rectores de las Universidades Chilenas está integrado por las rectoras y rectores de 30 universidades y es presidido por el ministro o ministra de Educación.

Su organización contempla un Comité Ejecutivo, conformado por ocho integrantes del Consejo, y una Secretaría General, que cuenta con un equipo técnico y de coordinación permanente. A esta labor se suman las comisiones permanentes y transitorias, que asesoran al Consejo en materias específicas del quehacer universitario.